Mediacoderin käynnistys onnistuu Käynnistä-valikon Mediacoder-hakemiston alta.
ja ensimmäisellä kerralla pitäisi aueta internet-selain, josta valitaan Start Medicoder, jonka jälkeen itse ohjelma aukeaa (Do not show this page on next startup estää tämän sivun aukeamisen jatkossa, jolloin itse Mediacoder aukeaa suoraan)
Mediacoder on hyvin yksinkertainen käyttää, jos videoihin ei halua tekstityksiä mukaan. Ohjelman käynnistyttyä valitaan aluksi Extensions -> Game consoles -> PSP
Mediacoder saattaa antaa tässä vaiheessa seuraavan varoituksen, joka ohitetaan OK-napilla. Remember my choice and do not show this prompt -asetus kannattaa pitää päällä, varsinkin jos Mediacoderia käyttää useilla eri profiileilla, jolloin taataan se, etteivät toisten profiilien tiedot jää taustalle vaikuttamaan uusien profiilien luonteihin
jonka jälkeen aukeaa Mediacoderin oma PSP-asetusvalikko, josta voidaan tarvittaessa muuttaa muunnoksessa käytettäviä asetuksia.
Format-kohdasta voidaan ottaa MPEG-4 SP- tai MPEG-4 AVC -valinta (AVC:lla saavutetaan parempi kuvanlaatu, mutta pakkaus kestää kauemmin). Resolution-kohdasta valitaan haluttu resoluutio, vaihtoehdoista 480x272 on hyvä laajakuvavideoille ja 320x240 tavallisen kuvasuhteen videoille. Video Quality -kohdasta voi nostaa videon bitratea (eli parantaa kuvanlaatua ja kasvattaa tiedostokokoa, tarkka kbps arvo näkyy alapuolella), Audio Quality -kohdasta voi tehdä saman ääniraidalle.
Mediacoder osaa myös siirtää videot automaattisesti PSP:lle. Jos PSP on kiinni tietokoneessa, näkyy siitä ilmoitus (esimerkkikuvassa PSP EI ole kytkettynä koneeseen, jolloin ohjelma ilmoittaa PSP is not connected).
Transfer files to PSP after done -valinta siirtää videot PSP:lle muuntamisen jälkeen. Muussa tapauksessa videot tallennetaan oletuksena samaan kansioon lähdevideon kanssa.
Tämän jälkeen voidaan ohjelman pääikkunasta lisätä videot, jotka halutaan muuntaa PSP:lle. Add file -valinnalla lisätään yksittäinen tiedosto muunnettavaksi ja Add Folder -valinnalla lisätään yksittäisen hakemiston kaikki videot.
Mikäli irtotekstit haluaa kiinteästi mukaan täytyy PSP:lle tehdä yksi alkuvalmistelu. Tämä on elokuvan ja tekstityksen nimeäminen samalle tiedostonimelle, eli esimerkiksi elokuvan_nimi.avi ja elokuvan_nimi.srt. Valitettavasti irtotekstin koon säätäminen ei toimi kunnolla toistaiseksi, joten tekstitys saattaa näkyä liian pienenä/suurena. Mediacoderin oman PSP-asetusvalikon kautta voi tarkistaa tekstien toimimisen painamalla Preview-nappia, jonka pitäisi toistaa video tekstien kanssa.